一、杠杆交易风险
融资融券业务具有杠杆效应，它在放大投资收益的同时也必然放大投资风险。投资者将股票作为担保品进行融资融券交易时，既需要承担原有的股票价格下跌带来的风险，又得承担融资买入或融券卖出股票带来的风险，同时还须支付相应的利息和费用，投资者由此承担的风险可能远远超过普通证券交易。
例：投资者以100万元普通买入一只股票，该股票从10元/股下跌到8元/股，投资者的损失是20万元，亏损20%；如果投资者以100万元作为保证金、以50%的保证金比例融资200万元买入同一只股票，再将100万元现金普通买入该股票，该股票从10元/股下跌到8元/股，投资者的损失是60万元，亏损60%。
二、强制平仓风险
投资者在从事融资融券交易期间，如果不能按照约定的期限清偿债务，或上市证券价格波动导致日终清算后维持担保比例低于警戒线，且不能按照《融资融券合同》约定的时间、数量追加担保物时，将面临担保物被证券公司强制平仓的风险，由此可能给投资者造成经济损失。
例：投资者信用账户中有现金100万元作为保证金，选定证券A进行融资买入，融资保证金比例为50%。在不考虑佣金和其他交易费用的情况下，投资者融资买入了200万元的证券A（融资买入40万股证券A,成交价为5元/股），此时账户维持担保比例为150%(资产300万元÷负债200万元=150%)。之后证券A价格连续下跌，第四天收盘价到3.8元/股，资产为252万元（40万股×3.8元/股＋100=252万元），融资负债仍为200万元，账户维持担保比例为126%，低于130%，证券公司立刻发出补仓通知，若投资者没有卖券还款也没有增加担保物，2个交易日后，证券公司根据合同将投资者信用账户中的证券A全部或部分卖出平仓。
三、监管风险 
监管部门和证券公司在融资融券交易出现异常、或市场出现系统性风险时，都将对融资融券交易采取监管措施，以维护市场平稳运行，甚至可能暂停融资融券交易。这些监管措施将对从事融资融券交易的投资者产生影响，投资者应留意监管措施可能造成的潜在损失，密切关注市场状况、提前预防。
四、其他风险
（一）投资者在从事融资融券交易期间，如果央行规定的同期金融机构贷款基准利率调高，证券公司将相应调高融资利率或融券费率，投资者将面临融资融券成本增加的风险；
（二）投资者在从事融资融券交易期间，如果其信用资质状况降低，证券公司会相应降低对投资者的信用额度，从而造成投资者交易受到限制，投资者可能遭受损失；
（三）投资者在从事融资融券交易期间，证券公司按照《融资融券合同》要求履行了相关信息的通知义务后，但投资者未能关注到通知内容并采取相应措施，就可能因此承担不利后果。